Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRT6CP48668 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms