Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTDSS1P48651 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms