Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIA4P48058 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms