Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC1A1P43005 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms