Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms