Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MDH1P40925 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MDH1P40925 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MDH1P40925 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MDH1P40925 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms