Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGAEP38570 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms