Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FDFT1P37268 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms