Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5C1P36542 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms