Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPA3P35244 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPA3P35244 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPA3P35244 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPA3P35244 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPA3P35244 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPA3P35244 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPA3P35244 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA3P35244 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms