Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OTX2P32243 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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OTX2P32243 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
OTX2P32243 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OTX2P32243 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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