Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP1P29466 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP1P29466 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP1P29466 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms