Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARID4AP29374 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms