Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD38P28907 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD38P28907 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD38P28907 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD38P28907 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms