Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PLNP26678 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PLNP26678 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms