Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms