Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP11P24347 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MMP11P24347 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MMP11P24347 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
MMP11P24347 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MMP11P24347 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MMP11P24347 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MMP11P24347 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MMP11P24347 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MMP11P24347 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MMP11P24347 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MMP11P24347 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP11P24347 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP11P24347 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms