Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GCSHP23434 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GCSHP23434 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms