Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXB9P17482 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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