Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB3P14651 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 779.8 ms