Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD8P13378 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms