Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

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Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DMDP11532 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DMDP11532 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DMDP11532 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMDP11532 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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