Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ESRRAP11474 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms