Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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