Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCM2O75603 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GCM2O75603 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCM2O75603 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCM2O75603 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCM2O75603 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCM2O75603 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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