Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms