Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPAG9O60271 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPAG9O60271 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms