Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDUFS4O43181 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS4O43181 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms