Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BCKDKO14874 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BCKDKO14874 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BCKDKO14874 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms