Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms