Protein–RNA interactions for Protein: V9GYY5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYY5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
V9GYY5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
V9GYY5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
V9GYY5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
V9GYY5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
V9GYY5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
V9GYY5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
V9GYY5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
V9GYY5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
V9GYY5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
V9GYY5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
V9GYY5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
V9GYY5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
V9GYY5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
V9GYY5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
V9GYY5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
V9GYY5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
V9GYY5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
V9GYY5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
V9GYY5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
V9GYY5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
V9GYY5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
V9GYY5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
V9GYY5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
V9GYY5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
V9GYY5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
V9GYY5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
V9GYY5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
V9GYY5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
V9GYY5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
V9GYY5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
V9GYY5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
V9GYY5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
V9GYY5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
V9GYY5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
V9GYY5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
V9GYY5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
V9GYY5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
V9GYY5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
V9GYY5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
V9GYY5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
V9GYY5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
V9GYY5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
V9GYY5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
V9GYY5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
V9GYY5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
V9GYY5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
V9GYY5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
V9GYY5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
V9GYY5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
V9GYY5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
V9GYY5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
V9GYY5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
V9GYY5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
V9GYY5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
V9GYY5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
V9GYY5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
V9GYY5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
V9GYY5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
V9GYY5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
V9GYY5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
V9GYY5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
V9GYY5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
V9GYY5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
V9GYY5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
V9GYY5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
V9GYY5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
V9GYY5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
V9GYY5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
V9GYY5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
V9GYY5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
V9GYY5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
V9GYY5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
V9GYY5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
V9GYY5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
V9GYY5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
V9GYY5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
V9GYY5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
V9GYY5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
V9GYY5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
V9GYY5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
V9GYY5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
V9GYY5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
V9GYY5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
V9GYY5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
V9GYY5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
V9GYY5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
V9GYY5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
V9GYY5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
V9GYY5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
V9GYY5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
V9GYY5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
V9GYY5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
V9GYY5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
V9GYY5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
V9GYY5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
V9GYY5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
V9GYY5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
V9GYY5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
V9GYY5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms