Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms