Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC4A4Q9Y6R1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC4A4Q9Y6R1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A4Q9Y6R1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A4Q9Y6R1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms