Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD54BQ9Y620 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAD54BQ9Y620 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD54BQ9Y620 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms