Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX13Q9Y5W8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX13Q9Y5W8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms