Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G9

PCDHGA4, Protocadherin gamma-A4, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA4Q9Y5G9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA4Q9Y5G9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA4Q9Y5G9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA4Q9Y5G9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms