Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR2E1Q9Y466 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR2E1Q9Y466 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR2E1Q9Y466 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms