Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPRKBQ9Y3C4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPRKBQ9Y3C4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TPRKBQ9Y3C4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms