Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRG3Q9Y2Y8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG3Q9Y2Y8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRG3Q9Y2Y8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRG3Q9Y2Y8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms