Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K5

R3HDM2, R3H domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM2Q9Y2K5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HDM2Q9Y2K5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HDM2Q9Y2K5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
R3HDM2Q9Y2K5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
R3HDM2Q9Y2K5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
R3HDM2Q9Y2K5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
R3HDM2Q9Y2K5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
R3HDM2Q9Y2K5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM2Q9Y2K5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM2Q9Y2K5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM2Q9Y2K5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM2Q9Y2K5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM2Q9Y2K5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HDM2Q9Y2K5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms