Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP11BQ9Y2G3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP11BQ9Y2G3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP11BQ9Y2G3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP11BQ9Y2G3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP11BQ9Y2G3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP11BQ9Y2G3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP11BQ9Y2G3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP11BQ9Y2G3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP11BQ9Y2G3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP11BQ9Y2G3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP11BQ9Y2G3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP11BQ9Y2G3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP11BQ9Y2G3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP11BQ9Y2G3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP11BQ9Y2G3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP11BQ9Y2G3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP11BQ9Y2G3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP11BQ9Y2G3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP11BQ9Y2G3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms