Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITM2BQ9Y287 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITM2BQ9Y287 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITM2BQ9Y287 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms