Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AGAP1Q9UPQ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP1Q9UPQ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms