Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP83

COG5, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG5Q9UP83 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG5Q9UP83 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG5Q9UP83 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG5Q9UP83 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
COG5Q9UP83 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG5Q9UP83 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG5Q9UP83 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG5Q9UP83 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG5Q9UP83 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COG5Q9UP83 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG5Q9UP83 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COG5Q9UP83 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COG5Q9UP83 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG5Q9UP83 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms