Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS0

NFU1, NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFU1Q9UMS0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFU1Q9UMS0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFU1Q9UMS0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFU1Q9UMS0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFU1Q9UMS0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms