Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI4Q9UM07 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PADI4Q9UM07 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PADI4Q9UM07 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms