Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAV3Q9UKW4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VAV3Q9UKW4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAV3Q9UKW4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms