Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRDM4Q9UKN5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM4Q9UKN5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM4Q9UKN5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms