Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CROTQ9UKG9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CROTQ9UKG9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROTQ9UKG9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms