Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FBXO3Q9UK99 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FBXO3Q9UK99 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FBXO3Q9UK99 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FBXO3Q9UK99 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FBXO3Q9UK99 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FBXO3Q9UK99 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FBXO3Q9UK99 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FBXO3Q9UK99 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FBXO3Q9UK99 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FBXO3Q9UK99 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FBXO3Q9UK99 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms